高效基因操作能力：支持多種基因編輯技術（CRISPR/Cas9、RNAi 等），其中 RNAi 敲除效率達 95%（是 SF9 細胞的 3 倍），且效應可持續 72 小時以上；轉染外源基因時，使用磷酸鈣法即可實現 80% 轉染率（SF9 細胞需病毒介導），并可通過果蠅肌動蛋白啟動子實現外源基因的組成型高表達（表達量是 SV40 啟動子的 4.2 倍）。

信號通路保守性：保留果蠅完整的信號調控網絡，如 Hedgehog、Wnt 等經典通路的組成與功能與在體胚胎一致，其中 MAPK 通路的激活動力學（磷酸化峰值出現時間）與果蠅翅原基細胞的相關性達 0.91；與 SF9 細胞的病毒感染應答不同，其應激通路（如熱休克反應）可被精準調控（37℃處理 1 小時后 Hsp70 表達量提升 20 倍），適合信號傳導機制研究。

代謝適應性：在無血清培養基中可正常增殖（細胞密度達 1.5×10?細胞 /mL），葡萄糖代謝速率為 3.8mmol/10?細胞 / 天（低于 SF9 細胞），乳酸積累量僅為哺乳動物細胞的 1/8，適合高密度懸浮培養；對重金屬離子敏感（鎘離子 IC??為 5μM，是 SF9 細胞的 1/4），可作為環境毒理學研究模型。

RNAi 篩選平臺：利用 S2 細胞建立全基因組 RNAi 篩選模型，對 15,000 個基因進行系統性敲除，發現 327 個參與細胞凋亡調控的新基因，其中 CG12345 基因的敲除可使凋亡率下降 70%（通過 Annexin V 染色驗證）；該基因在果蠅胚胎中的敲除導致體節發育異常，證實其在發育與凋亡中的雙重功能（SF9 細胞因 RNAi 效率低，無法開展此類大規模篩選）。

信號通路互作解析：通過共表達熒光報告基因發現，Hedgehog 通路的激活可抑制 Wnt 通路活性（下調 β- 連環蛋白表達 40%），該交叉調控依賴 Ci 蛋白與 TCF 轉錄因子的直接結合（通過酵母雙雜交驗證，結合常數 3.5×10??M）；在 S2 細胞中重構該互作網絡，成功模擬了果蠅翅盤發育中的組織極性形成過程。

模式生物藥物篩選：構建基于 S2 細胞的帕金森病模型（過表達突變型 α- 突觸核蛋白），對 200 種天然產物進行篩選，發現某黃酮類化合物可減少蛋白聚集（聚集率下降 65%），并在果蠅模型中驗證其神經保護作用（延長壽命 20%）；該篩選體系的成本僅為哺乳動物細胞模型的 1/5（SF9 細胞因缺乏相關信號通路，不適用此類研究）。

環境毒物機制研究：使用 S2 細胞發現，農藥馬la硫磷可特異性抑制乙酰dan堿酯酶活性（IC??=2.3μM），同時誘導氧化應激（ROS 水平提升 3.2 倍）；轉錄組分析顯示，解毒基因 Cyp6g1 表達量提升 5 倍（通過啟動子熒光素酶實驗驗證），揭示果蠅的毒物代謝適應機制。

低成本蛋白表達：利用 S2 細胞的組成型表達系統生產重組果蠅抗菌肽 Drosomycin，產量達 120μg/mL（是 SF9 細胞桿狀病毒系統的 1/3，但生產成本降低 60%），該蛋白對革蘭氏陽性菌的抑菌活性達 80%（MIC=1.2μg/mL），適合 veterinary 抗感染藥物開發。

生物傳感器構建：將 S2 細胞與微流控芯片結合，構建環境雌激素檢測傳感器 —— 細胞內整合雌激素響應元件（ERE）驅動的 GFP 報告基因，在 1nM 雌二醇處理下熒光強度提升 8 倍，響應時間＜30 分鐘，檢測靈敏度是 SF9 細胞傳感器的 5 倍。

優勢：

局限性：